Şiddetli kalsiyum noksanlığı durumunda biyolojik zarın yapısında genel bir bozulma görülür. Kalsiyum noksanlığının yol açacağı düzensizlikler ilk olarak kök uçları, büyüme noktaları ve depolama dokuları gibi genç meristematik dokularda başlar ve yaşlı dokulara doğru ilerler. Meristematik dokuların büyümesinde duraklamalar olur. Hücre duvarı çöker ve dokular sertliğini yitirir, Kalsiyum noksanlığının yapraklarda görülen ilk işareti orta damar boyunca yaprağın kıvrılmasıdır. Kıvrılma ile ayası kayık şeklini alan yaprak kalınlaşır ve gevrek bir yapı gösterir. Domateste çiçek uçburnu çürüklüğü,salatalıkta uç yanıklığı, patateste iç pas lekesi sıkça görülen bazı kalsiyum noksanlığı belirtileridir. Kalsiyum noksanlığı meyvelerde, özellikle elmalarda çok önemlidir. Elmalarda görülen acı benek kalsiyum noksanlığının bir sonucudur. Acı benek elmalarda derime yakın veya derimden sonra depolama sırasında meydana gelen ve karşıdan bakıldığında kabuğun üzerinde şekil bozukluğu oluşturan kahverengi-siyah beneklerle kendini belli eden bir fizyolojik bozukluktur.